Ilustracija Igora Bastidasa

Blockchains neće riješiti problem s Genomics-om

Ako ste čekali da vam se genome uredi, hoće li vas virtualni token zaista promijeniti?

Ovo će biti godina DNA za kripto-valutu. Jedno pokretanje za drugim nudi vam da vam plati u bitcoin-tokenima za dijeljenje vaših genetskih podataka. Najnovije od njih uključuje istraživač genetike i magnet za promidžbu George Church, koji je dio startapa, Nebula Genomics, koji će slijediti vaš genom za oko 1000 dolara i povezati vas u grupe koje žele kupiti pristup njemu. Platit će vam se u virtualnim žetonima Nebula, a zapis o tome tvrtke ili istraživači koji su pristupili vašim genomskim podacima pohranit će se u blok-lanac.

Ali teško je vidjeti kako će korištenje blockchaina i cryptocurrencies znatno povećati potražnju za sekvenciranjem genoma. To je neugodan problem jer je premalo genoma sekvencirano i analizirano da bi se stvorilo onoliko smislenih uvida koliko su se znanstvenici nadali. Od 2016. godine, samo 20 posto cjelina genoma bilo je od ljudi koji nisu bijeli, i bez pristupa potpunoj varijaciji ljudskog DNK, istraživači ne znaju dovoljno o tome koje varijante zapravo uzrokuju ili utječu na bolest.

Sljedeće je pitanje što su genomski podaci istraživačima sami po sebi beskorisni. Njegova korisnost dolazi kada je uparen s podacima o vašem fenotipu - osobinama i uvjetima koje imate. Te se informacije nalaze na mjestima poput vašeg elektroničkog zdravstvenog kartona ili medicinskog ispitivanja. Dakle, jesu li ti startapovi zabilježili transakcije na blockchainu manje su bitni nego hoće li moći prikupljati i upravljati fenotipskim podacima. To je trnije za obradu od DNK podataka; Messier je i dolazi u raznim vrstama.

Nebula nije prva tvrtka koja se našla na ideji upotrebe blockchaina kao osnove za tržište genomskih podataka, mada je očito jedina koja će slijediti i vaš genom. EncrypGen, Luna DNA, Longenesis i Zenome također koriste blockchains da bi zabilježili kako istraživači i kompanije komuniciraju s vašim DNK podacima. Ali u tim slučajevima donosite genetsko očitavanje koje ste dobili od drugih tvrtki, uključujući i one poput 23andMe ili Ancestry.com koje ne reduju čitave genome.

Blockchaini imaju snažne prednosti u pogledu privatnosti za genomske podatke. Blockchain je u osnovi javni zapis koji bi u ovom slučaju mogao pratiti svaki put kada se upotrebljavaju vaši podaci. Taj je zapis gotovo neprobojan jer se reproducira na više različitih mjesta u mreži i svatko mu može pristupiti. Tvrtke za lijekove ili akademski istraživači ne bi mogli koristiti vaše podatke bez vašeg znanja. To je u velikoj suprotnosti s načinom na koji se trenutačno tretira većina vaših podataka, kaže Polina Mamoshina, viša znanstvena osoba na Insilico Medicine, koja je u suradnji s bitcoin rudarom BitFury radi stvaranja dugovječnosti. "Trenutno postoji skriveno tržište podataka. Mnoge tvrtke prodaju naše podatke, što je vrlo vrijedno, a da mi za to ne znamo", kaže Mamoshina.

"Teško je reći hoće li ljudi to raditi."

Kao dodatnu zaštitu privatnosti, Maglina također neće dopustiti nikome da preuzme pojedinačne genetske podatke. „Dobra analogija je da ga mogu unajmiti; oni preko njega dobivaju kod ", kaže jedan od osnivača Nebule, Kamal Obbad. "Sve što dobiju zauzvrat su rezultati."

Ali korištenje blockchaina i iskorištavanje njegovih prednosti za privatnost znači plaćanje ljudima u kripto valuti. Njihovo plaćanje u dolarima zahtijevalo bi neko središnje tijelo da radi kao posrednik i izvršava uplate. Čak i osim razgovora o mjehurićima kripto valute, tokeli magline bit će korisni samo u mreži magline, jer istraživači ili kompanije koje žele pregledati bazu podataka genoma podataka Nebule plaćaju pristup. U teoriji, to omogućuje osobama koje dijele svoje podatke da prikupe popriličan dio vrijednosti koju pomaže u stvaranju. Ali ako nema dovoljno kupaca zainteresiranih za korištenje određene mreže Nebule, tokeni će vrijediti malo ili ništa. U međuvremenu, možete dobiti novac za dijeljenje svojih genskih podataka s tvrtkama poput DNASimple ili Genos.

"Teško je reći hoće li to ljudi raditi", priznaje Mamoshina. Zato Longenesis također planira pohraniti druge podatke koji bi mogli biti korisni istraživačima čak i ako nema DNK, uključujući takve fenotipske podatke kao što su krvni testovi, podaci koji se mogu nositi, pa čak i selfieje. Maglina također planira prikupiti ne samo genome, već i zdravstvene pretrage, elektroničku zdravstvenu evidenciju i podatke s nosivih materijala, kaže Obbad.

Ipak, s tim različitim vrstama podataka teško je raditi. "Integriranje različitih vrsta podataka nevijalni je izazov u strojnom učenju i zdravstvenoj zaštiti, a to je istina bez obzira koliko podataka imate", kaže Marzyeh Ghassemi, gostujući istraživač na Googleu Verily i postdoktorski istraživač na MIT-u. Obbad se slaže: "Veliki je izazov još nije riješen." Drugim riječima, konačna korisnost ovih genetskih tržišta vjerojatno će ovisiti o otvorenom pitanju koliko će se dobro baviti informacijama osim genoma. Genomi dobivaju naslove, ali relativno su jednostavni za rukovanje.

Sve vrijeme, postoji činjenica da nismo nizili dovoljno raznoliki niz genoma da bismo imali zaista veliko znanje o tome što oni znače za bolest i ljudsko zdravlje. Blockchain genomski podaci na tržištima govore o njihovoj sposobnosti da novače nove ljude za razmjenu genskih podataka, ali oni jednostavno mogu doći do istog skupa ljudi koji su već zainteresirani za predmet. Ghassemi sumnja da će uporaba blockchaina potaknuti raznovrsnije sudjelovanje koje bolje obuhvaća stvarne varijacije u ljudskim genima. "Ovo je težak problem," kaže, "i mislim da to nije problem na koji će se rješavati čisto tehnička rješenja."